Im Jahr 1955 fassten einige Garten- und Pflanzenfreunde den Plan, den Botanischen Garten München-Nymphenburg in seinen Aufgaben, insbesondere bei der Vergrößerung des Pflanzenbestands, der Verbesserung der Kulturanlagen und der Förderung der wissenschaftlichen Forschung tatkräftig zur Seite zu stehen. Es sollte so die wissenschaftliche und technische Leitung in ihren Aufgaben unterstützt und das Interesse der Allgemeinheit an der botanischen Wissenschaft gehoben werden.

Zu diesem Zweck wurde beschlossen, eine Gesellschaft der Freunde des Botanischen Gartens München zu gründen. Der Verein wurde 1956 ins Vereinsregister eingetragen und ein Vorstand und ein Kuratorium bestimmt. Vorsitzender des Kuratoriums wurde Ernst von Siemens, von dem auch die Initiative zur Gründung der Gesellschaft ausging.

40 Jahrfeier

Im Jahre 1996 wurde anlässlich des 40-jährigen Bestehens der Gesellschaft die Ernst von Siemens-Medaille gestiftet.

50 Jahrfeier

Am 14. Juli 2006 feierte die Gesellschaft ihr 50-jähriges Bestehen. Sie ist in diesen 50 Jahren auf über 1200 Mitglieder angewachsen und hat ihren Gründungszweck durch zahlreiche und vielfältige Leistungen für den Garten in großartiger Weise erfüllt.